为了及时补偿施工生产过程中的各种耗费，反映施工生产活动的经营成果，在采用分旬或月中预支、月末或竣工结算工程价款的方式下，施工企业可以按照每旬或半月完成的分部分项工程量，填制工程价款预支帐单，向建设单位预收工程款。
施工企业在旬末或月中预收的工程款，应在月终或竣工结算时，全部从应收的工程价款中扣还，并在工程价款结算帐单中列明应扣除的预收工程款数额。在施工企业会计中，预收工程款的收取和扣还，应设置预收工程款帐户核算。贷方登记按照工程进度于每旬末或月中向建设单位预收的工程款，借方登记工程价款结算时，从应收的工程款中扣还的预收工程款。月末一般应无余额。但对于竣工时一次结算的工程，月末则有余额，反映尚未扣还的预收工程款。对于预收工程款，施工企业还应按建设单位的户名设置明细帐，进行明细核算。
一、如何进行纳税申报？
一是预收工程款不发生纳税义务。
财税〔2016〕36号附件1：《营业税改征试点实施办法》第四十五条第（二）项的规定，纳税人提供建筑服务采取预收款方式的，其纳税义务发生时间为收到预收款的当天。但按照财税［2017］58号文件的规定，建筑施工企业收到建设单位或总包方预付的工程款只需要预缴，暂时不产生纳税义务。之所以如此修改，主要是考虑到预收工程款时，尚未取得进项税，会被提前缴纳。那么，预收款到底何时产生纳税义务？笔者认为，在工程施工过程中，随着建设单位或总包方对工程价款的不断确认和计量，也就是进行了工程价款结算，便达到了纳税人发生应税行为并收讫销售款项的纳税义务时间，这时预收的工程款陆续产生纳税义务。当然，如果建筑施工企业在预收到工程款时，给建设单位或总包方开具了征税的建筑服务，这时符合了先开具的，为开具的当天的纳税义务时间规定，全部开票金额便立即产生了纳税义务。
二、分公司可以收工程款吗
不可以，需要总公司授权委托分公司代收工程款。分公司具备法人资格，核算，自负盈亏，这样就可能在某些方面和总公司有业务往来。双方之间签订购销合同也正常。另外，分公司可以对外签订合同。
《营业税暂行条例》第五条规定，纳税人的营业额为纳税人提供应税劳务、转让无形资产或者销售不动产收取的全部价款和价外费用。